Florence Cloppet

Formation/Fonctions

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LIPADE           SIP           UPC

Contact

Courriel
 florence.cloppet_at_u-paris.fr

☏ Téléphone
 +33 (0)1.76.53.02.77

✉ Adresse
 LIPADE - EA2517, Équipe SIP
 UFR Mathématiques et Informatique
 (Bureau 705-M)
 Université Paris Cité
 45 rue des Saints Pères
 75270 Paris Cedex 06 (France)

Research

Keywords

Analyse d'images Interprétation d'images Reconnaissance de Formes Segmentation Informations/Connaissances Perception/Vision par Ordinateur Sélection de caractéristiques
Systèmes multi-agents Recherche d'images par le contenu Agrégation multi-critères
Marqueurs Intelligents Imagerie Biomédicale Analyse d'images de documents

wordle

Collaborations

l3i      liris      crestic IDV      IRHT      SOM     

Projets

Je suis impliquée (ou ai été impliquée) dans différents projets de recherche dans le domaine de l'analyse d'images de documents ou de l'imagerie biomédicale.

Projets en cours

EYCON

Projet eycon (2021-2024)

Involvement : Resp. partie images

Funding: chaire - Idex

L’objectif central d’EyCon est d’explorer des solutions computationnelles pour augmenter les possibilités de visualisation, de navigation et d’analyse de grands corpus visuels.

IA_PACS

Projet iaPacs (2021-2024)

Involvement : Responsable

Funding: Idf - Philips

Le projet iaPacs porte sur l’intégration d’un moteur de recherche d’images par le contenu dans une base d’images médicales pour apporter une aide aux médecins radiologues dans l’interprétation d’images en routine clinique et la prise de décision.

Projets terminés

SHADES

ANR TIMES (2017-2021)

Involvement : Member (16 %)

Funding: French Agence Nationale de le Recherche

Le projet TIMES vise à développer l'analyse de séries d'images satellitaires pour étudier les changements dynamiques de notre planète, sa couverture végétale et sa couverture urbaine. L'objectif de ce projet est de fournir de nouvelles techniques à hautes performances pour mettre en correspondance et suivre les changements environnementaux à partir de données massives, hétérogènes et saisies avec une fréquence élevée. L'équipe SIP du Lipade, a en charge la partie traitement d'images, avec comme mission principale le développement et la validation de nouvelles méthodes d'analyse d'images dédiées à la détection et au suivi de changements environnementaux d'éléments du paysage (c.a.d érosion des côtes, déformation de surfaces, changements de la couverture végétale etc.) à partir de l'exploitation de masses de données géospatiales hétérogènes (images aériennes, satellitales, nuage de points) acquises avec une fréquence temporelle élevée. Le projet ANR TIMES est une collaboration entre des équipes d'informaticiens reconnues en analyse d'images et reconnaissance de formes (LIPADE, MIPS, MONASH (Australia) and SERTIT-ICUBE), et des équipes expertes en géographie environnementale (LIVE and ICUBE-SERTIT).
SHADES

SHADES

ANR SHADES (2014-2018)

Taux d'implication: Membre (22 %)

Financement: Agence Nationale de la Recherche - France

Le projet SHADES (Semantic Hash for Advanced Document Electronic Signature) est un projet interdisciplinaire portant sur la sécurité des documents, en partenariat avec des acteurs et des chercheurs des domaines de l'Informatique et du Droit. L'objectif de ce projet est de fournir un nouvel outil permettant l'authentification de l'intégrité du contenu d'un document par le biais du calcul d'une signature, fondée sur le contenu textuel et graphique. Cette signature doit être robuste et compacte afin de lutter contre la fraude et la falsification. Le projet est réalisé en collaboration avec un tiers de confiance comme utilisateur final.

IDV

Programme Interdisciplinaire Imageries du Vivant: entre progrès et libertés (2014-2018)

Taux d'implication: Membre (22 %)

Financement: USPC - France

Le programme IDV (Imageries du Vivant) est un programme centré sur

  • l'animation d'un réseau interdisciplinaire de recherche rassemblant les collègues et équipes qui travaillent sur la génération/acquisition des images biomédicales et sur leur exploitation;
  • sur la création d'un environnement dédié à l'exploitation des grandes masses de données images générées (Big Data) pour le développement de nouveaux Biomarqueurs en imagerie;
  • sur une réflexion sur les problèmes éthiques et juridiques soulevés par l'exploitation des images du vivant.
Dans le cadre de ce projet, nous travaillons plus particulièrement sur la construction d'un atlas intelligent en lien avec la thématique de recherche d'images et de cas similaires. Ce travail est également en collaboration avec le laboratoire Quantitative Imaging (Stanford School of Medicine) de l'Université de Stanford.

Oriflamms

ANR ORIFLAMMS (2013-2016)

Taux d'implication: Membre (18 %)

Financement: Agence Nationale de la Recherche - France

Le projet Oriflamms (Ontology Research, Image Features, Letter form Analysis on Multilingual Medieval Scripts) rassemble des laboratoires du domaine des Sciences Humaines et Sociales (SHS), des laboratoires du domaine des Sciences et Technologies de l'Information et de la Communication (STIC) et une société industrielle (A2iA) pour améliorer, avec une approche interdisciplinaire et novatrice, la transcription des documents anciens en introduisant une connaissance liée aux systèmes et formes d'écriture du Moyen Âge selon leur contexte de production et leur langue. Les travaux de l'équipe SIP du Lipade portent sur l'étude de la variabilité des formes contenues dans les écritures.

DOD

OSEO DOD (2013-2016)

Partenaire associé

Financement: OSEO - France

Le projet DOD (Offre de Dématérialisation de Documents) est en partenariat avec la société industrielle Itesoft-Yooz. L'objectif de ce projet est d'identifier et d'étudier les dégradations qu'une image de document peut contenir par rapport au document initial. Dans un contexte d'acquisition (par capteur photo ou scanner) délocalisée par rapport à l'exploitant des documents, il s'agit donc de mesurer la qualité de l'image et de l'améliorer dans la mesure du possible.

Graphem

PIA - PiXL (2012-2014)

Taux d'implication : Membre (22 %)

Financement: Projet Investissements d'Avenir (PIA - France)

Dans le cadre d'un objectif de constitution d'un technopôle de dématérialisation et de valorisation des contenus numériques, ce projet a été centré sur des documents provenant du service des cartes et plans de la BNF, et des documents administratifs fournis par IteSoft. Les centres d'intérêt sont la couleur, le manuscrit/imprimé, la sécurisation et la mobilité. La tâche de l'équipe SIP du Lipade a consisté en la séparation du manuscrit et de l'imprimé.

Graphem

ANR Graphem (2008-2011)

Taux d'implication : Membre (15 %)

Financement: Agence Nationale de la Recherche - ANR France

Le projet GRAPHEM (Aide à l'expertise paléographique et à l'accès au contenu dans les écritures médiévales) est un projet pluridisciplinaire qui s'appuie sur les très riches corpus de manuscrits du Moyen-Âge ; il a la double ambition de :

  • contribuer à créer une véritable paléographie objective et scientifique,
  • créer des méthodes efficaces d'accès au contenu de ces manuscrits reposant sur la similarité d'images de ces mots (Word-Spotting, Word-Retrivial).
La richesse et la diversité des écritures (issues de la langue latine) permettront d'élaborer et de tester des descripteurs de formes qui seront employés dans les deux cas, une attention particulière sera portée à l'étude du graphème entendu comme un petit morceau de trait portant une information pertinente. Les laboratoires constituant le consortium sont le LIRIS, l'IRHT, le LIFO, le CRIP5 et l'Ecole des Chartes. Ils ont déjà travaillé ensemble, il y a quelques années, dans un projet d'exploration de ces manuscrits médiévaux, projet appartenant au programme "Société de l'Information" du CNRS et intitulé "Formes et Couleurs, outils de recherche". C'est dans ce contexte que la formulation de GRAPHEM a été initialisée. Les résultats escomptés sont de nature différente. Pour la paléographie, il s'agit d'un développement de connaissances, de la formalisation du domaine. Les méthodes d'accès au contenu textuel ont vocation à être utilisées dans d'autres contextes que le manuscrit du Moyen-Âge. Elles ont un caractère sémiotique et font partie de ce que l'on pourrait appeler les alternatives aux méthodes de reconnaissance optique des caractères (O.C.R.).

Navidomass

ANR NAVIDOMASS (2007-2010)

Taux d'implication : Membre (25 %)

Financement:Agence Nationale de la Recherche - ANR France

L'objectif du projet NaviDoMass (NAVIgation into DOcument MASSes)est d'aider un utilisateur en sciences humaines à indexer et faire des recherches dans des grandes masses de documents anciens, par l'analyse des différents éléments images et texte,mais aussi de la structure du document ancien. NAVIDOMASS est fondé sur quatre grands principes : N'importe où (un accès global), N'importe qui (public et multi-langues), N'importe quand et N'importe quel média (différents modes de transmission de l'information : portail Web, Interface Smartphone, réimpressions de documents etc.).

Publications

Lien sur une liste classée des conférences en Informatique.

Ma page sur scopus et ma page sur DBLP:

scopus      DBLP


A. Articles dans Journaux Internationaux

B. Chapitre de Livres

C. Articles dans Revues Nationales

D. Articles dans Conférences Internationales

E. Articles dans Conférences Nationales

F. HDR / Doctorat

Travail Éditorial

Revues internationales générales

Revues internationales d'Imagerie Biomédicale

Enseignement

TeachingYO

A. Responsabilités actuelles de cours


Université Paris Descartes (France)


@ UFR de Mathématiques et d'Informatique

  • Licence 2 Informatique
    • MLL3U2O : Programmation Impérative - Langage C

  • Master Informatique, Master 1
    • MMC1E31 : Bases du traitement du signal et des images (co-responsabilité)

    • MMF3E12 : Goémétrie algorithmique

  • Master Informatique, Master 2, Spécialité Image and Plurimedia
    • UE Projet(co-responsabilité)
      • MMF3E72:Construction d'un projet
      • MMF3E72: Travail bibliographique
      • MME3U4: Projet de développement

@ Faculté des Sciences Fondamentales et Biomédicales

  • Master Biomedical Engineering
    • BMH109 : Computer Programming - Langages Java & Python
    • BMH303 : Medical Image Analysis I (co-responsabilité)

B. Responsabilités Administratives

Université Paris Descartes (France)


@ Faculté des Sciences Fondamentales et Biomédicales

  • [Depuis 2010] Co-responsable de la spécialité BioIMaging (M2) du master Biomedical Engineering BIM / BME
    La spécialité BIM offre une formation interdisciplinaires de haut niveau gràce aux compétences complémentaires de ParisDescartes et de ParisTech. Un vaste réseau de laboratoires de recherche permet aux étudiants d'accéder à des systèmes d'imagerie industriels et expérimentaux utilisant des technologies innovantes.

@ UFR de Mathématiques et d'Informatique

  • [2007-2010] Responsable de la spécialité ISV (M2) du master Informatique appliquée aux Sciences du Vivant (ISV)

C. Domaines enseignés au cours de ma carrière

  • Analyse d'images
    • Traitement d'images
    • Imagerie Biomédicale
    • Gémétrie Algorithmique
    • Reconnaissance de Formes

  • Activité de Programmation
    • langages : Java, Python, C++, C, HTML, TurboPascal
    • Algorithmique et Structures de données
    • Génie Logiciel

  • Bureautique (Word, Excel, PowerPoint)

Encadrement d'Étudiants

PhD experiments

J'ai (ai eu) le plaisir de travailler avec les personnes suivantes


Post-Doctorant-e-s

  • Zografoula Vagena (2023)
    Sujet: Semantic coherence integration for optimizing imaging retrieval systems in radiology
    Université: Université Paris Cité
    Financement: diip Strategic Project
    Encadrant(s): F. Cloppet, C. Kurtz
    Période: 2023 - 2024

  • Van Cuong Kieu (18 mois)
    Sujet:Estimation et correction du Flou dans les images de documents
    Financement: Itesoft
    Encadrant(s): F. Cloppet, N. Vincent
    Période: 2015- 2017

  • Sameh Hamrouni (9 mois)
    Sujet: Séparation de texte imprimé/manuscrit
    Université: Paris Descartes
    Financement: Pixl - Investissemnt d'Avenir
    Encadrant(s): F. Cloppet, N. Vincent
    Période: 2014

Doctorant-e-s

  • Xioyang Wei (Doctorat en cours)
    Sujet: Combining visual and textual information for enhancing pathologic case retrieval systems in radiological practices
    Université: Université Paris Cité
    Financement: China Scholarship Council (CSC)
    Encadrant(s): F. Cloppet, C. Kurtz
    Période: 2022 - 2025

  • Thibault Sauron (Doctorat en cours)
    Sujet:Search for similar pathological cases in radiological image databases
    Université: Université Paris Cité
    Financement: IDF-Philips
    Encadrant(s): F. Cloppet, C. Kurtz
    Période: 2021- 2024

  • Héloïse Alhéritière
    Sujet: Sécurisation des documents hybrides par une analyse physique des contenus
    Université: Paris Descartes
    Financement: ANR SHADES
    Encadrant(s): N. Vincent (co-directrice de thèse), J.M. Ogier (co-directeur de thèse), F. Cloppet (30%), C. Kurtz
    Période: 2015 - 2018

  • Soumaya Trabelsi
    Sujet: Analyse et suivi des anomalies mammaires à partir d'imagerie multimodales IRM/mammographie
    Université: Paris Descartes (France) - ENIS (Tunisie)
    Financement: Grant from Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche Tunisien
    Encadrant(s): L. Wendling (co-directeur de thèse), D. Sellami Masmoudi (co-directrice de thèse), F. Cloppet (25%)
    Période: 2014 - 2019

  • Arnaud Boucher
    Sujet: Recalage et analyse d'un couple d'images : Application aux mammographies
    Université: Paris Descartes (France)
    Financement: Cifre - Fenics
    Encadrant(s): N. Vincent(Doctoral Advisor), F. Cloppet (50%)
    Période: 2009 - 2013

  • Hassan Chouaib
    Sujet: Sélection de caractéristiques: méthodes et applications
    Université: Paris Descartes (France)
    Financement: ANR Navidomass
    Encadrant(s): N. Vincent (Directrice de Thèse), F. Cloppet (50%)
    Période: 2008 - 2011

  • Sylvain Berlemont
    Sujet: Analyse d'image d'ADN peigné, extraction des entités linéaires et extraction de patterns
    Université: Paris 5 (France)
    Financement: Cifre - Genomics Vision
    Encadrant(s): N. Vincent (co-directrice de thèse), J.C. Olivo-Marin (co-directeur de thèse - Institut Pasteur), F. Cloppet (20%)
    Période: 2005 - 2008

  • Elodie Dusch
    Sujet: Détection, localisation et suivi de spots modélisés par mixture de gaussienne
    Université: Paris 5 (France)
    Financement: Institut Pasteur Corée
    Encadrant(s): N. Vincent (co-directrice de thèse), A. Genovesio (co-directeur de thèse - Institut Pasteur Corée), F. Cloppet (10%)
    Période: 2005 - 2008

  • Estelle Glory
    Sujet: Segmentation de cellules observées par microscopie en contraste de phase
    Université: Paris 5 (France)
    Financement: Cifre - Celogos
    Encadrant(s): G. Stamon (co-directeur de thèse), J.C. Olivo-Marin (co-directeur de thèse - Institut Pasteur), F. Cloppet (30%)
    Période: 2002 - 2005

  • Santiago Venegas-Martinez
    Sujet: Analyse et segmentation de séquences d'images en vue d'une reconnaissance de formes efficace
    Université: Paris 5 (France)
    Financement: Grant from Mexican Governement
    Encadrant(s): G. Stamon (Directeur de Thèse), F. Cloppet (20% - last year)
    Période: 1999 - 2002

  • Emmanuel Augustin
    Sujet: Reconnaissance de mots manuscrits par un système hybride : Modèles de Markov Cachés et Réseaux de Neurones
    Université: Paris 5 (France)
    Financement: Cifre - A2iA
    Encadrant(s): G. Stamon (Directeur de Thèse), F. Cloppet (20% - last year)
    Période: 1998 - 2001

  • Mohammed Borchani
    Sujet: Caractérisation, recherche et appariement d'images par attributs de texture
    Université: Paris 5 (France)
    Encadrant(s): G. Stamon (Directeur de Thèse), F. Cloppet (30% - last year)
    Période: 1997 - 2001

  • Yann Dieulangard
    Sujet: Compression sélective d'images segmentées : Application au codage d'images infrarouges pour le renseignement
    Financement: Cifre - Aerospatiale
    Université: Université René Descartes (France)
    Encadrant(s): G. Stamon (Doctoral co-advisor), D. Barba (Doctoral co-advisor), F. Cloppet (20% - last year)
    Période: 1995 - 1998

  • Vannary Meas-Yedid
    Sujet: Analyse de cartes scannées : interprétation de la planche de vert
    Financement: MESR - Ministère de la Recherche et de l'Enseignement Supérieur (France)
    Université: Université René Descartes (France)
    Encadrant(s): G. Stamon (Directeur de Thèse), F. Cloppet (20% - last year)
    Période: 1995 - 1998

Diplôme de Master - Stages de Recherche

  • Zixuan Wang
    Cursus: Ecole Centrale de Nantes (France)
    Subject: Early fusion of multiple MRI sequences for enhancing pathologic case retrieval systems in radiology
    Funding: diip M2 project Encadrant-e(s): C. Kurtz, F. Cloppet
    Période: 2022, 6 mois

  • Guillaume Sérieys
    Cursus: Master BME (Université Paris Cité, France)
    Subject: Combining visual and textual information for enhancing image retrieval systems in radiological practices
    Funding: diip M2 project Encadrant-e(s): C. Kurtz, F. Cloppet
    Période: 2021, 6 mois

  • Alexandre Landrodie
    Cursus: Master Informatique Informatique-VMI (Université Paris Descartes, France)
    Subject: Classification d'images de textes en manuscrit ou imprimé à l'aide de réseaux de neurones
    Funding: IMDS Encadrant-e(s): F. Cloppet, N. Vincent
    Période: 2020, 6 mois

  • Walid Amaieur
    Cursus: Master Informatique IP (UniversitéParis Descartes, France)
    Subject: Extraction de tableaux dans une image de document
    Supervisors: Héloïse Alhéritière, C. Kurtz, F. Cloppet, N. Vincent
    Période: 2018, 4 mois

  • Jordan Gonzalez
    Formation: Master 2 Informatique IMA (Université Pierre and Marie Curie, France)
    Sujet: Recherche de muti-séquences d'IRM similaires: étude de l'utilité du re-ranking
    Encadrant(s): C. Kurtz, F. Cloppet et Laure Fournier (collaboration avec l'APHP-HEGP / Projet Imageries du Vivant - USPC)
    Période: 2017, 6 mois

  • Lylia Yakouben
    Formation: Master 2 Informatique IP (Université Paris Descartes, France)
    Sujet: Détection de signature dans une image de document
    Encadrant(s): Héloïse Alhéritière, C. Kurtz, F. Cloppet, N. Vincent
    Période: 2016, 5 mois

  • Yanki Sesyilmaz
    Formation: Master 2 Informatique IMA (Université Pierre and Marie Curie, France)
    Sujet: Recherche d'images similaires dans des bases radiologiques : Application aux séquences d'IRM des masses ovariennes
    Encadrant(s): C. Kurtz, F. Cloppet and Laure Fournier (collaboration avec l'APHP-HEGP / Projet Imageries du Vivant - USPC) Période: 2016, 6 mois

  • Cao Deng Feng
    Formation: Master 1 Biomedical Engineering (Université Paris Descartes, France)
    Sujet: Fusion of EPR and Micro CT imaging to obtain full-scale anatomical and functional information
    Encadrant(s): F. Cloppet, Yves Frapart
    Période: 2016, 2 mois

  • Pineiro Zarate Ivan
    Formation: Master 1 Biomedical Engineering (Université Paris Descartes, France)
    Sujet: Radiological image retrieval in big databases (PACS): Integration of specific global quantitative features focusing on local regions of interest (ROI) in the images.
    Encadrant(s): F. Cloppet, C. Kurtz
    Période: 2016, 2 mois

  • Héloïse Alhéritière
    Formation: Master Informatique IP (Université Paris Descartes, France)
    Sujet: Extraction de la structure d'un document digitalisé
    Encadrant(s): N. Vincent, F. Cloppet, C. Kurtz
    Période: 2015, 5 mois

  • Neila Adili
    Formation: Master Informatique RIP-Image (Université Paris Descartes, France)
    Sujet: Quantifier la variabilité des écritures dans un contexte d'adaptation d'algorithmes dans un système de transcription automatique des zones d'écriture de documents du Moyen-Âge
    Encadrant(s): N. Vincent, F. Cloppet
    Période: 2014, 6 mois

  • Frédéric Moreau
    Formation: Master Informatique RIP-Image (Université Paris Descartes, France)
    Sujet: Analyse d'images écho-cardiographiques
    Encadrant(s): N. Vincent, F. Cloppet
    Période: 2013, 6 mois

  • Mejdi Djerbel
    Formation: Master Informatique RIP-Image (Université Paris Descartes, France)
    Sujet: Recalage d'images multimodales RPE et MicroCT
    Encadrant(s): F. Cloppet, Yves Frapart
    Période: 2011, 6 mois

  • Houssem Gueziri
    Formation: Master Informatique RIP-Image (Université Paris Descartes, France)
    Sujet: Segmentation d'images ultrasonores
    Encadrant(s): F. Cloppet, N. Vincent
    Période: 2011, 6 mois

  • Arnaud Boucher
    Formation: Master Informatique PCC-Image (Université Paris 5, France)
    Sujet: Étude et Élaboration d'un algorithme de segmentation d'images biologiques
    Encadrant(s): F. Cloppet
    Période: 2007, 5 mois

  • Isabelle Boudoux
    Formation: DESS Informatique Appliquée aux Sciences de la Vie (Université Paris 5, France)
    Sujet: Utilisation de la texture pour la segmentation d'images biologiques
    Encadrant(s): F. Cloppet
    Période: 2001, 6 mois

  • Anne-Laure Lefeuvre
    Formation: DESS Informatique Appliquée aux Sciences de la Vie (Université Paris 5, France)
    Sujet: Segmentation d'images de lymphocytes obtenues par microscopie optique
    Encadrant(s): F. Cloppet
    Période: 2000, 6 mois

Diplôme d'Ingénieur - Stage de Recherche

  • Carlos Tor Díez
    Formation: Engineering degree in Telecommunication (Universitat Politècnica de Catalunya, BarcelonaTech, Barcelona, Spain)
    Sujet: Integrating relevance feedback in content-based image retrieval applications for medical imaging
    Encadrant(s): C. Kurtz, F. Cloppet (and partnership with Télécom ParisTech)
    Période: 2015, 5 mois

  • Manel Ben Ameur
    Formation: Projet de Fin d'Etudes ENIS, Ecole Nationale d'Ingénieurs de Sfax (Tunisie)
    Sujet: Quantifier la variabilité des écritures dans un contexte d'adaptation d'algorithmes dans un système de transcription automatique des zones d'écriture de documents du Moyen-Âge
    Encadrant(s): N. Vincent, F. Cloppet
    Période: 2015, 4 mois

  • Paul-André Idoux
    Formation: Engineering degree in Computer Science (EPITA Graduate School of Computer Science, Paris, France)
    Sujet: Large-scale content-based image retrieval in medical imaging
    Encadrant(s): C. Kurtz, F. Cloppet
    Période: 2014, 6 mois

  • Pierre-Paul Couka
    Formation: Engineering degree in Computer Science (ESME-Sudria Graduate School of Computer Science, Paris, France)
    Sujet: Segmentation d'images couleur en vue de caractériser le degré d'interaction de protéines au cours du cycle cellulaire
    Encadrant(s): F. Cloppet
    Période: 2006, 6 mois